自从后帝发现了火以后，黄帝因嫉妒而处处打压他，女娲补天后黄帝就拿女娲的事情来讽刺后帝，后帝因气不过而带领着自己的人马脱离了神族独自去了希腊发展。后帝毕竟对神族做出过很大贡献，黄帝不好带兵去剿灭后帝，所以黄帝只能承认后帝部落是神族的分支，并封后帝为神支王。

燧人氏走后，随着神族的进一步发展，三大首领逐渐发现生物死后都有灵魂，且这些灵魂是构成新生命的基本元素，可是由于没有管理者，所以灵魂们的秩序非常混乱，弄的神族也不得安宁。鉴于这种情况，神族就建立了冥界来管理灵魂，由人王伏羲出任冥界首领。因为人是有灵性的生物，这也是区别人与其他生物的重要原因，黄帝看人（用泥土造的人）不同于其他生物，所以建立了神界，并且自己出任了神界的首领。由于很多生物既不属于神界也不属于冥界，所以黄帝又建立了自然界来管理它们，由炎帝出任自然界的首领。三界的形成有利于地球的发展，也为各个物种间以后各司其职奠定了基础。

黄帝建立了三界后封三大首领为三皇，即黄帝为神皇，炎帝为自然皇，伏羲为冥皇。神皇给了神界的人一个统一的称号“神”，职责是保卫地球。自然皇把自然界中的生物分为动物.植物和微生物三大类，他让动植物改变地球的面貌，微生物则负责分解掉死去的动植物保持地球的清洁。冥皇也给了冥界的灵魂们了一个名称“鬼”，负责管理鬼的被他称为鬼差，鬼差负责正确引导鬼组成新的生命体。

三界完全完善后，地球得到了稳定且长远的发展，神族也趁这个机会大力发展自身的实力，使得魔族很长的一段时间不敢进犯。