自从神族发动那场战争把魔族赶出了地球以后，魔族就一直在反思自己的缺点并努力的发展着自身的力量，为以后的回归积极地备战。但因为神族的力量过于强大，特别是三界形成以后神族的力量可谓是日新月异，所以魔族始终也不敢有所行动。

但好景不长，由于神族太过安宁，使得黄帝渐渐失去了原有的精明，迷上了花天酒地的生活，这就使得神界大乱，进而带动了三界动乱。虽然自然皇和冥皇及时的发现并控制了动乱，但他们也不好出面去管理神界的动乱，所以只能向神皇上书请求神皇出面制止动乱。可是神皇黄帝根本不理会他们的请求，气的冥皇伏羲不管神界动乱自己带着人马回冥界了。自然皇炎帝虽然也很生气，但知道这样下去不行，所以决定自己亲自去劝说黄帝。

自然皇炎帝来到了神皇黄帝的宫殿前，守门卫士竟然这样说“神皇有令，除非他召见否则任何人不许进去”炎帝听后顿时火冒三丈打了进去。

进入宫殿的炎帝看到了黄帝醉生梦死的样子，上去就给了黄帝两个重重的耳光，从梦中惊醒的黄帝看到了眼前的炎帝说“自然皇你怎么来了，有事吗？”，炎帝气呼呼地说“你~~你自己出去看看吧”，黄帝一边问着炎帝怎么了一边向外走着，等到黄帝走到外面时完全被眼前的情形震惊了，此时炎帝开口把事情的始末告诉给黄帝，得知真相的黄帝羞愧难耐，立即整顿了神界，到了这里动乱才算真正的平息了。

在动乱期间神族的力量不仅没有向前发展而且还后退了许多；而魔族却在这时飞速的发展力量已经可以和神族相比了。

当神族刚刚平息了动乱，魔族已经发动了回归的战争，神族仓促应战，双方的战事正式展开。因为战事展开之际神族已经从三界动乱的阴影中走了出来，所以想轻松的打败神族也不是那么容易的，战事陷入了焦灼。

在最后一战中，双方都拿出了必胜的决心，三皇更是力战魔族的四大首领，最终双方都损失惨重，神魔十祖损失了四个即黄帝.伏羲.天魔.山魔，而且魔族的地魔还被三皇封印了，不过夜魔还是带领着人马占领了一半地球，与神族形成了对峙的局面，且剩余的力量也比神族大的多，幸亏燧人氏带着人马及时赶到才避免了神族的灭顶之灾。

经过这次大战后，魔族虽回到了地球，但由于元气大伤也很长时间没有作为。

这场战争被后来的六道称作“神魔大决战”。